Kirurgisk behandling består som regel av å fjerne den syke delen av tarmen. En forsøker alltid å fjerne så lite tarm som mulig. Av og til benytter en kirurgiske teknikker med korreksjon av forsnevringen uten at en fjerner noe av tarmen.
Tarmreseksjon (tynntarmreseksjon eller tykktarmreseksjon)
Ved dette inngrepet fjerner man kun det tarmavsnittet som forårsaker pasientens symptomer og / eller komplikasjoner. Det er viktig for å unngå uønsket påvirkning av tarmfunksjon og næringsopptaket. Tarmreseksjon involverer ofte tynntarm, men kan også dreie seg om deler av tykktarmen. Den resterende delen av tarmen blir koblet sammen igjen.
Strikturoplastikk
Dette er en kirurgisk teknikk som blir benyttet når det ikke er ønskelig eller gunstig med fjerning av (ytterligere) tarm. Ved hjelp av denne teknikken korrigerer man forsnevringen og gjenoppretter uhindret passasje i tarmen.
Stomi (utlagt tarm)
Vanligvis blir kontinuiteten i fordøyingskanalen bevart etter at et tarmavsnitt er blitt fjernet, men noen pasienter må få utlagt tarm (stomi), det vil si en pose på magen for oppsamling av tarminnholdet.